台南市南科特定區開發區塊A區（特A區）迎來重大的土地權利轉軌程序。台南市政府原先於二〇二六年六月與台積電完成簽署五十年期專案設定地上權契約，規劃作為先進晶圓製造廠擴建基地；然而，國科會南部科學園區管理局後續啟動資產盤整與治理模式調適，決議運用「科學園區管理局作業基金」編列逾三百億元預算，直接向台南市政府整批購回特A區近五十公頃產業用地，正式啟動納入科學園區實體管轄之報院與都市計畫變更程序，預計於二〇二七年上半年完成納編。這項重組將土地利用由地方自治範疇下的地上權租賃，全面轉軌為《科學園區設置管理條例》專屬之「公有土地只租不售」法制架構。
從土地產權與法規環境分析，地方層級的商業型設定地上權契約，在法律關係與管理層級上仍需受制於地方自治法規、地價評議委員會之公告地價浮動機制，以及地方議會監督等變數。對於投資規模動輒數千億元之先進晶圓廠而言，長期營運的高度確定性是維持國際供應鏈信任的重要前提。南科管理局透過作業基金實施國家資本買斷，將產權回歸中央專責機關持有並落實只租不售，在制度上排除了土地日後可能面臨的私法處分、抵押或合約屆期續約爭議，建立起具備高度法制穩定性與排他性保護的產業用地防線。
在行政效能與跨機關協調層面，納入科學園區管轄能大幅降低多頭行政審查的摩擦成本。科學園區體系長期具備「單一窗口」法定職能，建照核發、環境保護審查、消防安全稽核與勞動檢查等權限高度集中於管理局統籌處理，並直接對接保稅通關、特用化學品輸入免稅等中央專屬權限；此外，面對先進製程對特高壓電力雙迴路、高規格再生水專管與大宗氣體管廊的龐大需求，納編為中央園區亦有助於經濟部、台電與台水等公用事業依據國家級重大基建層級，進行管線規劃與專案施工，提升整體工程推進效率。
對地方財政而言，這項土地所有權轉移亦實質改善了大台南的資本調配彈性。台南市庫藉由本次土地處分獲得超過三百億元的非稅課收益，能有效挹注地方公共建設自籌財源，支援周邊捷運深綠線、鐵路地下化延伸工程及重要聯外路網的推動，並適度舒緩地方政府公債發行壓力。透過中央出資買斷收歸國家管理、地方取得充裕基建資金的雙向協同，特A區的納編在化解行政權能分散與法規不確定性的同時，進一步穩固了先進製程在南台灣長期深耕的實體與制度基礎。
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