台灣軍民通用無人機產業在邁向大規模量產與實戰化部署的關鍵階段，正遭遇跨部會權責破碎引發的「體制性摩擦」。2026 年 8 月底，立法院三讀通過 6 年 2,400 億元《強化國防自主暨無人載具產業發展條例》；然而，審計部最新中央政府總決算審核報告指出，行政院統籌型計畫在專屬飛測場域建置上進度停滯，且國內系統整合商通過資安檢測比率僅約三成，直接削弱切入國際政府採購的競爭力。經濟部產發署回應坦言，空域管制與飛測場域主管機關為交通部民航局，資安規範主管機關為數發部，經濟部僅能扮演跨部會橫向溝通與幕僚角色。這種「多頭馬車、各行其是」的行政結構，使民間無人機廠商在研發、實機飛測到資安認證的全流程中，耗費極高時間與合規成本。
市場與國防科技產業治理分析指出，跨部會權責割裂與無人機全流程驗證剛需的對撞，宣告了「僅靠預算補貼、缺乏統一行政接口」推動軍工產業模式的邊際遞減；台灣無人載具產業正迎來一場「治理摩擦成本拆解與跨部會一站式認證」的制度重構。
針對行政割裂阻礙技術迭代週期、專屬飛測與資安瓶頸壓制外銷動能的結構，分析師指出，無人載具從原型機到具備戰備水準，必須經歷高頻率的實空飛測與極端環境驗證，同時需要符合嚴苛的去紅化資安標準。當主管機關權責分散於經濟部（輔導）、交通部（空域）與數發部（資安）時，審批流程冗長導致飛測場域排擠與資安認證卡關。這項制度摩擦直接拉長了產品驗證週期，使本土廠商在搶攻全球非紅供應鏈的先機上承受無謂的效率折損。
與此同時，整合跨部會單一權責窗口，也正為產業建立制度性防衛護城河。
分析師強調，面對 2,400 億元軍工資本的陸續投放，行政體系必須設立具備跨部會實質裁決權的常設協調機制。唯有將空域申請、場域飛測與資安檢測整合為「一站式綠色通道」，才能有效降低民間供應鏈的體制摩擦成本，將龐大的國防採購預算實質轉化為具備國際競爭力與戰備韌性的實體產業護城河，築牢去風險與國家關鍵科技資產保全的終極防禦底牌。
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